尽管并不是广为人知，但电子废物确实是含有非常多的有毒物质，如电路板上的铅和镉；显示器中阴极射线管中的氧化铅和镉；纯平型显示器中的汞；电脑电池中的镉；电容和转换器中的多氯联苯（PCBs）；电路板中的溴化阻燃物；还有当燃烧电线取铜会释放出高毒性物质二噁英和呋喃的PVC塑料。
由于电子废物的有害性，处理和回收它们涉及到严格的法律和环保要求，当电脑废物被填埋或焚烧掉时，会产生很严重的污染问题，填埋会使有毒物渗漏到地下水中，而焚化则会产生包括二噁英等的气体有毒物。然而，电脑的回收处理也会牵涉到健康和环境问题，特别是当回收工业以利润为第一位，而不采取措施保护环境和工人健康时。
铅——铅的有害影响早已为人们所公认，早在70年代就被有的国家禁用于汽油中。铅能损伤人的中枢和脑神经系统、血液系统、肾以及生殖系统，而且会对小孩的大脑发育有负面影响，铅能在环境中累积，从而对动植物、微生物都有强烈而且长久的影响。电脑中的主要含铅部位有：电脑显示器的玻璃荧屏（1.4~3.5千克/每台显示器），电路板或其他元件的焊接物。
镉——镉的化合物对人也是非常有害的，会在人体中积累，尤其是在肾中。镉含于以下元件中，SMD电阻器，红外线发生器，半导体等，镉也是塑料的固化剂，在旧的阴极射线管中也含有它。
汞——汞会造成很多器官的损伤，包括大脑、肾、卵巢，更严重的是，胎儿的发育会对母体传过来的汞相当敏感。我们知道，当无机汞洒落入水中时，就会转化为甲基汞沉在底部。甲基汞很容易在体内积累，以及通过食物链富集，尤其是鱼。据估计全世界每年耗用的汞22%是用在电子电气产品中，它用于温度计、传感器、阻滞器、转换器（比如在电路板以及测量装置中），医疗设备、电灯、手机以及电池中。汞，现在用于纯平显示器荧屏，逐渐取代了原来的阴极射线管显示器。
六价铬——六价铬仍被用于钢片的防锈以及坚化和美化处理。它很容易穿过细胞膜然后被吸收，而后对被污染了的细胞产生毒害影响。六价铬也会损伤DNA，是一种在环境中极毒的物质。
包含PVC的塑料——每台电脑平均有13.8镑的塑料。大量的用于电子产品的塑料（26%）是含有PVC的，PVC主要是用于包裹线路和电脑外壳，尽管现在很多电脑模具已经开始用无毒的ABS塑料了。PVC被广泛应用主要是由于它的防火特性，同很多其它的含氯化合物一样，PVC在一定温度下燃烧时也会产生二噁英。
溴化阻燃物（BFRs）——BFRs被用在电子产品的塑料外壳、以及电路板中以防止发烟，有些类型的BFRs已被欧洲议会定为在2003~2006年间取消的目标。
钡——钡是一种软的银白色的金属，被用于电脑显示器阴极射线管荧屏上，是为了保护用户免遭辐射，研究显示即使是短期暴露于钡也会导致脑肿、肌肉无力，以及损伤心脏、肝脏和脾脏。但没有关于长期暴露于钡对人的影响的资料。动物的研究表明，喂食钡一段时期后血压升高，心脏也发生变化。
铍——铍是一种钢灰色的金属，相当的轻、坚硬，也是电和热的良导体，而且没有磁性，这些特性使得铍很适于各种工业用途，包括，像电脑这样的电子产品。在电脑中，铍被广泛用于主板和键盘底片（铍与铜的合金用于加强连接体弹性同时保持导电性）。铍最近被认为是导致肺癌的致癌物。最主要的担忧是铍磨损产生的灰、雾。长期接触铍的工人，即使是很小剂量，也会容易导致“铍长期症”，一种肺病。接触铍也会导致一种皮肤病，特征是轻微擦伤和肿起，研究表明即使不再接触铍，甚至多年后仍会有“铍长期症”。
油墨——电脑的外部设备如打印机中包含有黑色或彩色的油墨。黑色油墨的主要成分是碳黑。呼吸是主要的接触途径，强烈的接触会导致刺激呼吸系统。国际癌研究机构（The International Agency for Research on Cancer）将碳黑定为2B类致癌物，对人可能是致癌的。对彩色油墨还没什么相关研究，一些报告显示这些彩色油墨（蓝、黄和红）中包含重金属。
磷化物及其它添加物——磷化物是一种无机化合物，它被应用于阴极射线管（CRTs）玻璃内表面的包衣。磷光效应是我们可以看见的显示器图像。CRTs中磷的有害性并不为人知，但美国海军在他们的指导条例中是这么说的：“不要碰CRTs的磷包衣：它有剧毒。如果你打破了CRTs，小心地清理掉玻璃碎片。如果你碰到了磷化物。赶紧找医生处理。”磷包衣还含有重金属，比如锌、钒等作为添加物。这些金属及其化合物也是有毒的。这些都是对那些用手工拆卸CRTs的工人会有危害的。